Optimierung der quantitativen Gelelektrophorese für die pharmazeutische Analytik

Deng, Xi

Die Gelelektrophorese ist eine sehr beliebte Methode für die Proteomforschung und in der Proteinanalytik. Obwohl die Gelelektrophorese bereits eine altbewährte Trenntechnik ist, lässt die Präzision dieser Methode noch sehr zu wünschen übrig. Mit Hilfe von SOPs und unter Anwendung der VIS-NIR-Detektion, konnte eine verbesserte Präzision für die 1-dimensionale Gelelektrophorese (1-DE) erreicht werden. Mittels der 2-dimensionalen Gelelektrophorese (2-DE) werden Proteine anhand ihrer isoelektrischen Punkte und Molekularmasse getrennt. Manche Proteine erscheinen auf 2-D Gelen nicht als einzelner Punkt, sondern in Form einer an eine Perlenkette erinnernde Reihe, d. h. es sind nur Unterschiede in isoelektrischen Punkten zu beobachten, nicht aber in der Masse. In dieser Arbeit werden mögliche Ursachen und verbesserte Quantifizierungsmethoden vorgestellt. Der dritte Teil dieser Arbeit behandelt die Identifizierung von Ausreißern in univariaten Datensätzen.

Gel electrophoresis is a common technique widely used for proteome research and protein analysis. Although this method has been developed decades ago, there is still a considerable need to improve its precision. By using SOPs and VIS-NIR detection the precision for 1-dimensional gel electrophoresis (1-DE) could be improved. By 2-dimensional gel electrophoresis (2-DE) proteins are separated according to their isoelectric points in the first dimension and molecular masses in the second dimension. Some proteins show multiple spots spreading along the first dimension (charge train group). Possible reasons and improved quantification methods for proteins with charge train groups are presented. The last part of this work deals with the improvement of outlier detection for univariate data.

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Deng, Xi: Optimierung der quantitativen Gelelektrophorese für die pharmazeutische Analytik. 2012.

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