Pseudomonas aeruginosa population structure revisited under environmental focus

Selezska, Kateryna

In dieser Arbeit wurde eine populationsgenetische Studie an mehr als 430 Umwelt-Stämmen von /Pseudomonas aeruginosa/ durchgeführt. Die Stämme stammten zum größten Teil aus Flusssystemen in Norddeutschland. Es wurden mehrere genetische Linien identifiziert, darunter eine offensichtlich besonders gut an die Umwelt angepasste Linie. Es zeigte sich, dass die Verteilung der Linien in verschiedenen Umwelt-Habitaten nicht gleichförmig war. Es konnten ökologische Kriterien identifiziert werden, die mögliche Ursachen für das beobachtete Verteilungsmuster darstellen können. Die Ergebnisse zeigen letztendlich, dass verschiedene Selektionsdrücke für das kladogenetische Aufspaltungsmuster der evolutiven Linien innerhalb der Art /P. aeruginosa/ verantwortlich sind. Diese Studie verschiebt somit das klinisch begründbare aber von einer globalen Perspektive her jedoch unzutreffende Verständnis von /P. aeruginosa/ als opportunistischem Krankheitserreger hin zu der tatsächlichen Darstellung von /P. aeruginosa/ als Umweltorganismus.

In this work a population genetic study of more than 430 environmental strains of P. aeruginosa, mostly from river systems in Northern Germany but also from worldwide distributed sampling places is reported. We identify several genetic lineages, of which one is apparently of a predominantly environmental nature. We observe a non-random distribution in environmental habitats and we identified ecological criteria which may be explanatory for this. The results suggest that different selective pressures aid to drive the cladogenic split of evolutionary lineages within P. aeruginosa. This study shifts the clinically motivated (but from a global perspective rather narrow) focus of P. aeruginosa as an opportunistic pathogen to its rather true nature as an environmental organism.

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Selezska, Kateryna: Pseudomonas aeruginosa population structure revisited under environmental focus. 2010.

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